Το οργανόγραμμα του ΙΑ-ΙΤΕ παρουσιάζεται στη δεξιά εικόνα.
Διευθυντής του Ινστιτούτου από τις 6 Μαρ. 2019 είναι ο Χαρμανδάρης Βασίλης και Αναπληρώτρια Διευθύντρια από τις 18 Ιουλ. 2021 είναι η Παυλίδου Βασιλική.
Το τρέχον Επιστημονικό Συμβούλιο του Ινστιτούτου, ορίστηκε στις 21 Απρ. 2021 και αποτελείται από τους
Καθοριστικό ρόλο στη διαμόρφωση της στρατηγικής ανάπτυξης του ΙΑ έχει η Εξωτερική Επιστημονική Συμβουλευτική Επιτροπή η οποία ορίστηκε στις 22 Ιουν. 2019 και αποτελείται από τους
- Blandford Roger, Professor of Physics, Stanford University (ΗΠΑ)
- Caselli Paola, Director Max-Planck Institute for Extraterrestrial Physics (Γερμανία)
- Helou George, Executive Director IPAC/Caltech (ΗΠΑ)
- Jason Spyromilio, Senior Astronomer, ESO (Γερμανία)
- van der Klis Michiel, Professor of Astrophysics, Amsterdam University (Ολλανδία)